Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRBP28702 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRBP28702 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRBP28702 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRBP28702 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRBP28702 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRBP28702 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRBP28702 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRBP28702 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRBP28702 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRBP28702 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RXRBP28702 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RXRBP28702 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RXRBP28702 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RXRBP28702 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRBP28702 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRBP28702 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRBP28702 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRBP28702 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRBP28702 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRBP28702 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRBP28702 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRBP28702 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRBP28702 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRBP28702 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRBP28702 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRBP28702 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRBP28702 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRBP28702 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRBP28702 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRBP28702 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRBP28702 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRBP28702 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRBP28702 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms