Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB5P28074 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms