Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms