Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IL3RAP26951 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL3RAP26951 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms