Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLNP26678 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLNP26678 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLNP26678 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLNP26678 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLNP26678 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLNP26678 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLNP26678 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLNP26678 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLNP26678 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLNP26678 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLNP26678 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLNP26678 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms