Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms