Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms