Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAMP1P23763 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms