Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX3P23760 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX3P23760 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX3P23760 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX3P23760 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX3P23760 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX3P23760 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX3P23760 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PAX3P23760 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX3P23760 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX3P23760 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAX3P23760 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAX3P23760 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX3P23760 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX3P23760 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX3P23760 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PAX3P23760 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PAX3P23760 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX3P23760 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAX3P23760 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms