Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KB1P23443 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms