Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBG1P23258 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBG1P23258 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms