Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2P22307 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2P22307 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2P22307 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2P22307 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCP2P22307 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCP2P22307 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCP2P22307 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCP2P22307 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCP2P22307 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2P22307 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCP2P22307 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCP2P22307 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCP2P22307 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCP2P22307 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2P22307 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms