Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms