Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT1P21579 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT1P21579 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT1P21579 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT1P21579 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT1P21579 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYT1P21579 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYT1P21579 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYT1P21579 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT1P21579 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT1P21579 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT1P21579 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT1P21579 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT1P21579 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT1P21579 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT1P21579 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT1P21579 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT1P21579 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT1P21579 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT1P21579 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT1P21579 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT1P21579 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT1P21579 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT1P21579 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT1P21579 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT1P21579 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT1P21579 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT1P21579 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT1P21579 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT1P21579 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYT1P21579 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT1P21579 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT1P21579 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms