Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NF1P21359 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NF1P21359 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NF1P21359 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NF1P21359 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NF1P21359 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NF1P21359 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NF1P21359 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NF1P21359 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NF1P21359 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NF1P21359 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NF1P21359 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NF1P21359 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms