Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms