Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF7P17544 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF7P17544 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF7P17544 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF7P17544 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF7P17544 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF7P17544 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF7P17544 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF7P17544 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF7P17544 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF7P17544 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF7P17544 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF7P17544 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF7P17544 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF7P17544 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF7P17544 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF7P17544 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF7P17544 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF7P17544 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF7P17544 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF7P17544 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF7P17544 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF7P17544 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF7P17544 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF7P17544 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF7P17544 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF7P17544 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF7P17544 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF7P17544 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF7P17544 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF7P17544 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF7P17544 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7P17544 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms