Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB8P17481 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms