Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPD1P17405 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPD1P17405 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms