Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA2P17301 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA2P17301 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms