Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB4P16144 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ITGB4P16144 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms