Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA1P15976 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA1P15976 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA1P15976 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms