Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYL4P12829 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYL4P12829 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYL4P12829 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYL4P12829 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYL4P12829 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYL4P12829 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYL4P12829 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYL4P12829 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYL4P12829 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYL4P12829 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYL4P12829 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYL4P12829 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL4P12829 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL4P12829 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL4P12829 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL4P12829 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms