Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRFP11831 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRFP11831 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRFP11831 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRFP11831 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRFP11831 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFP11831 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFP11831 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFP11831 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFP11831 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFP11831 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRFP11831 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRFP11831 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRFP11831 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRFP11831 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRFP11831 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRFP11831 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms