Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK4P11802 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK4P11802 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK4P11802 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK4P11802 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK4P11802 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK4P11802 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK4P11802 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK4P11802 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK4P11802 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK4P11802 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK4P11802 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK4P11802 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK4P11802 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK4P11802 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK4P11802 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK4P11802 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms