Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBP3P10745 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP3P10745 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP3P10745 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP3P10745 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP3P10745 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP3P10745 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP3P10745 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP3P10745 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP3P10745 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP3P10745 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms