Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG8P0DPA2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSIG8P0DPA2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms