Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBSLP0DN79 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms