Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms