Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49CP0CI26 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49CP0CI26 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49CP0CI26 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49CP0CI26 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49CP0CI26 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49CP0CI26 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49CP0CI26 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM49CP0CI26 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms