Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOP08100 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOP08100 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOP08100 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOP08100 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOP08100 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOP08100 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOP08100 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOP08100 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms