Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALB1P05937 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALB1P05937 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALB1P05937 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALB1P05937 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALB1P05937 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALB1P05937 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALB1P05937 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALB1P05937 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALB1P05937 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALB1P05937 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALB1P05937 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALB1P05937 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CALB1P05937 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms