Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNAP02545 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNAP02545 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNAP02545 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNAP02545 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNAP02545 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNAP02545 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNAP02545 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNAP02545 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms