Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL2A1P02458 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL2A1P02458 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL2A1P02458 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms