Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM13AO94988 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM13AO94988 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms