Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SOGA1O94964 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
SOGA1O94964 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SOGA1O94964 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms