Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF6O94906 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF6O94906 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF6O94906 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms