Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN15O75808 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN15O75808 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms