Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA4O75335 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms