Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUPR1O60356 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms