Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms