Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNA2O43921 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EFNA2O43921 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms