Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXTL3O43909 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL3O43909 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms