Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3O43889 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3O43889 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3O43889 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3O43889 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3O43889 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3O43889 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms