Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR2O43760 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR2O43760 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms