Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR1O43759 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms