Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR3O43731 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms