Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2AO43633 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms