Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB3O43448 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms