Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERI3O43414 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERI3O43414 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERI3O43414 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERI3O43414 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERI3O43414 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERI3O43414 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERI3O43414 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERI3O43414 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERI3O43414 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERI3O43414 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERI3O43414 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERI3O43414 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERI3O43414 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERI3O43414 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERI3O43414 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms